Atlético Nacional y Sao Paulo se han enfrentado en ocho ocasiones, tanto por Copa Libertadores como por Copa Sudamericana, con un balance de tres triunfos para cada uno y dos empates.
En Copa Libertadores se han enfrentado en cuatro ocasiones en las ediciones de 2008 y 2016, siendo en esta última la segunda vez que el Verde se coronó campeón de la Gloria Eterna, en esa ocasión con Reinaldo Rueda como entrenador.
Por Libertadores se suman dos victorias, un empate y una derrota. Las victorias fueron en 2016 (0-2 en Morumbí con doblete de Miguel Ángel Borja a los 82 y 88 minutos, luego, en el duelo de vuelta en el Atanasio Girardot el triunfo fue 2-1, nuevamente con doblete de Borja, a los 16 y 78 minutos, este último tanto de penal.
Los otros dos enfrentamientos por Libertadores datan de 2008, cuando en condición de local Nacional empató 1-1 con Sao Paulo y luego en la visita cayó 2-1.
